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生物信息领域牛刊修仙版

在知乎上看到生物信息学领域的牛刊投稿顺序,发现一个很有趣的回答,于是转载一下作为参考: 凡人期:这是修仙之路的起点,指的是还未开始修炼或刚刚接触修炼之道的普通研究生。 arXiv,bioRxiv 练气期:这是修仙的基础阶段,研究生修行者开始吸收天地灵气,将其转化为体内的元力。 BMC genomics,BMC bioinformatics,BMC biology,BMC medical genomics 筑基期:这是研究生修仙之路的起点,修行者开始修炼内功,累积内力,打下坚实的基础。 Bioinformatics,PLoS computational biology,PLoS genetics,Briefings in bioinformatics,BMC medicine 金丹期:修行者的内力能够凝聚成金丹,这个金丹象征着高级别的修为和力量。 Nucleic Acids Research,eBiomedicine,Advanced Science,PLoS Biology 元婴期:修行者的金丹形成元婴,元婴是修行者灵魂和修为的化身,跨入更高的境界。 Genome Biology,Genome Medicine,Genome Research,Molecular Systems Biology,Cell systems 化神期:修行者的元婴进一步成长,开始向神灵的境界转变。 Nature Communications,PNAS,Science Advances,Cell Reports 合体期:修行者的身体和灵魂开始与周围的世界融合,接近于自然(Nature)的本源。 Nature Machine Intelligence,Nature Computational Sciences 大乘期:修行者几乎达到了仙道的巅峰,具备了创造或改变世界的能力。 Nature Genetics,Nature Biotechnology,Nature Methods,Nature Medicine,Cell Genomics 飞升期:修行者完成了修仙之路,失去凡体,飞升仙界,无相无形,成为自然(Nature)。 Nature,Science,Cell Acknowledgement: 作者:浪矢Ryan 链接:https://www.zhihu.com/question/21660698/answer/3310893434 来源:知乎

docker拉取镜像修改打包教程

近期因为工作需求和提高用户友好度的考量需要对软件进行Docker打包,于是总结以下简易流程。 拉取镜像,如果需要预先配置好CUDA等,可以搜索对应镜像: 1 docker pull nvidia/cuda:12.2.2-cudnn8-devel-ubuntu22.04 进入镜像,修改软件配置环境等: 1 2 docker run --gpus all -it nvidia/cuda:12.2.2-cudnn8-devel-ubuntu22.04 /bin/bash apt-get update && apt-get install -y wget nano vim curl less 安装Conda环境以及其它需要的软件 1 2 curl -O https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2023.09-0-Linux-x86_64.sh bash Anaconda3-2023.09-0-Linux-x86_64.sh 新建repository https://hub.docker.com/repository/ 用docker commit从容器打包镜像 1 2 sudo docker ps -a sudo docker commit -m "AutoBA" -a "juexiao_zhou (www.joshuachou.ink)" 12748b01449a joshuachou666/autoba:cuda12.2.2-cudnn8-devel-ubuntu22.04-autoba0.0.3 然后docker images就能在本地找到打包好的镜像 上传镜像 1 2 3 4 5 # sudo docker login --username=用户名 sudo docker login --username=admin # sudo docker push 镜像tag sudo docker push joshuachou666/autoba:cuda12.

全新Ubuntu18.04配置DL环境,保姆级教程

获取IP地址 1 2 sudo apt install net-tools ifconfig 安装openssh,这样可以远程ssh连接服务器 1 sudo apt install openssh-server 安装gcc 1 sudo apt install gcc g++ make 安装NVIDIA驱动 在https://www.nvidia.com/Download/index.aspx?lang=cn下载对应型号驱动 1 wget https://cn.download.nvidia.com/XFree86/Linux-x86_64/535.104.05/NVIDIA-Linux-x86_64-535.104.05.run 禁用nouveau 1 2 3 4 5 sudo nano /etc/modprobe.d/blacklist.conf # 最后一行加入 blacklist nouveau sudo update-initramfs -u sudo reboot 检查nouveau是否不在运行 1 2 lsmod | grep nouveau # 没输出代表禁用生效 sudo telinit 3 安装驱动 1 2 sudo chmod a+x NVIDIA-Linux-x86_64-535.104.05.run sudo sh ./NVIDIA-Linux-x86_64-535.104.05.run --no-opengl-files –no-opengl-files 参数必须加否则会循环登录,也就是loop login